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小米手机短信自动删除可能有以下几种原因。
1、可能是开启了短信的自动删除功能，可以进入手机短信界面，查看短信设置，确认是否开启了自动删除功能，如果开启了，可以根据个人需求选择关闭或调整相关设置。
2、手机中毒或者安装了某些清理软件导致短信被误删除，建议不要随意下载未知来源的软件，可以在应用市场中下载并安装软件，如果怀疑手机中毒，可以通过杀毒软件进行扫描和清理。
3、短信存储量满了，也会导致短信无法保存，可以尝试删除一些不需要的短信或者将短信移至存储卡。
4、手机硬件问题也可能导致短信自动删除，如果手机有硬件故障，比如内存问题或者主板问题，可能需要专业的维修人员来检查和修复。
如果以上方法都不能解决问题，建议联系小米的官方客服或者到小米的维修点进行检测和修复。